Pour mener à bien ces différentes missions pour la protection et la valorisation du bassin versant de l'Erdre, la Fédération des Amis de l'Erdre s'appuie sur une équipe de bénévoles actifs, un salarié médiateur de rivière et une animatrice nature.

Le Conseil d'Administration est composé de 12 membres actifs:

- Simon PREVOST, Coprésident

- Gaël Prévoteaux, Coprésident

- Claude ROUSSELOT, Vice-Président

- Claudine MINIER, Trésorière

- Schéhérazade AISSANI-TRISSON, Secrétaire

- Jean-Claude HAURAY, Vice secrétaire

- Colette HAURAY, Administratrice

- Pascale NAFRAICHOUX, Administratrice

- Lionel JARNOUX, Administrateur

- Guy CROUPY, Administrateur

- Hervé BOCHER, Administrateur

- Clément POTIRON, Administrateur

- Annick VIDAL, Présidente d'honneur

Un poste emploi tremplin a été créé en Avril 2009 pour accompagner les bénévoles et développer les projets de l'association. Depuis septembre 2019, Gwendoline MONIER est médiatrice de rivière salariée pour la Fédération des Amis de l'Erdre.

Depuis Novembre 2018, Julie HUSSON a rejoint l'équipe FAE et est en charge du pôle animation.

Les permanents sont occasionnellement accompagnés par des stagiaires spécialisés.